يتولى مجلس ادارة المركز جملة من المهام التي تمثل توجهات المركز البحثية ويمكن تلخيصها على النحو التالي:

1.  اعداد الخطط البحثية السنوية ضمن الخطوط البحثية للمركز واقامة السمنارات الداخلية لمناقشة تلك الخطط.

2.  اقامة الندوات والحلقات النقاشية لتوضيح رؤية المركز واهدافه وتوجهاته البحثية.

3.    اعداد النشرات الارشادية والكراسات التعريفية من اجل تفاعل بناء بين الجامعة والمجتمع.

4.    ابرام اليات التعاون ومذكرات التفاهم مع الدوائر المعنية والجهات العلمية المتخصصة لتعزيز الخبرات لكوادر المركز والتعريف بنتاجاتهم البحثية .

5.    اعداد خطة لتطوير الكوادر البحثية علمياً ولغوياً ووضع البرامج اللازمة لذلك.

6.    استثمار الامكانات المتاحة للمركز من مختبرات ومساحة زراعية تقدر بنحو 15 دونم ضمن مفهوم المركز البحثي المنتج والجامعة المنتجة.

7. إقامة الدورات التدريبية للموارد البشرية وتطوير قدراتها ومهاراتها للوصول إلى الاستثمار الأمثل للموارد الطبيعية في مناطق أعالي الفرات.